Pour faire une recherche dans un répertoire nommé rep, avec des fichiers d’extention .md ScriptRecherche basiqueDans votre .bashrc, créer la fonction suivante, il s’agit d’un grep couplé à un sort. Le $@ permet de passer des arguments dans la fonction : # Fonction de recherchesrh () { grep -R --color "$@" /chemin/vers/le/répertoire | sort} Recherche évoluéeUne version plus évoluée de cette fonction, avec sed et awk, le “µ” désigne le caractère de remplacement : # Fonction
Différences entre un agregat, un volume, un FlexVol, un qtree et un LUN sous NetApp. Le schéma ci-dessous donne un aperçu général : AggregateDéfinitionAggregate : ensemble de disques physiques, généralement montés en RAID. Un aggregate est un ensemble de disques (ou partitions) organisés en un ou plusieurs RAID. Il s’agit de l’unité de stockage la plus élémentaire au sein d’ONTAP et il est nécessaire pour permettre l’approvisionnement d’espace pour les hôtes connectés. Commandes de basePour la
Un qtree NetApp est un répertoire avec des propriétés particulières. Le “Q” signifie “quota”, les FlexVols sont maintenant de plus en plus utilisés dans NetApp car ils peuvent également être limités par des quotas. Propriétés des qtreesGénéralitéLes qtrees possèdent d’autres propriétés : 4995 qtrees possibles par volume interne sont similaires aux répertoires (partitions de volume plus exactement) permettent de gérer les quotas d’utilisation de l’espace disque limitation de la taille du qtree
Vous trouverez ci-dessous un certain nombre d’exemples de scripts pouvant être utilisés comme modèle pour créer vos propres scripts de soumission SLURM. Simple scripts de soumissionLes jobs nécessitent un fichier de script que SLURM interprète et exécute. Le fichier SBATCH contient à la fois des commandes spécifiques à SLURM à interpréter ainsi que des programmes à exécuter. Vous trouverez ci-dessous un exemple simple d’un job pour exécuter un fichier Stata do. ScriptCe fichier est nommé myscrip
Il est possible de modifier les droits puis de supprimer le contenu de répertoires spécifiques en utilisant la commande find, combinée à l’exécution de commandes ciblées sur les résultats trouvés. Trouver et supprimerSi vous voulez changer les droits et supprimer tous les dossiers du répertoire /John qui commencent par “test” et finissent par “.bdr” : # find /home/John/ -type d -name "test*.bdr" -exec sh -c 'chmod u+w {}/* ; rm -f {}/*' \; VérificationEn
Equivalences des commandes SLURM/SGE Commandes utilisateur Explications Commande Slurm Commande SGE Interactive login # srun --pty bash # qlogin # srun -p "part_name" --pty bash # sdev Job submission # sbatch [script file] # qsub [script file] Job deletion # scancel [job_ID] # qdel [job_ID] Job status all # squeue -all # qstat -f Job status # squeue [job_ID] # qstat -u \ * [-j job_ID] Job user status # squeue -u [user name] # qstat [-u user name] Job hold # sco
Cheat sheet des commandes NetApp les plus utiles. Certaines commandes sont très longues et pour plus de facilité : la version PDF ici Note : - En cours - certaines commandes ne sont pas encore bien organisées DocumentationDocumentation PDF ONTAP : ONTAP_9_Documentation.pdf https://arkit.co.in/netapp-cluster-mode-commands-cheat-sheet/https://library.netapp.com/ecmdocs/ECMP1155684/html/GUID-89A9ACCA-501C-42DB-949B-B57B9AFBBB98.htmlhttps://community.netapp.com/t5/ONTAP-Discussions/Data-ONTAP-Basic
Il existe quatre composants principaux dans Slurm : le compte Unix, les groupes Unix, les comptes Slurm et les associations Slurm. Sous UnixCompte/utilisateur UnixTout utilisateur doit avoir un compte unix pour s’authentifier à un cluster. Certaines informations sont également associées à ce compte comme le shell par défaut, le $HOME, etc. La commande getent passwd $USER permet d’en savoir plus le compte unix. Groupes UnixChaque compte/utilisateur Unix appartient à au moins un groupe, du même no
Il est possible de spécifier une QOS (Quality Of Service) pour chaque jobs soumis dans Slurm, la commande sacctmgr permet de les gérer. Gérer les QOSManipulation des QOSAjoutAjouter une nouvelle QOS : # sacctmgr add qos ParticuleCalc Ajouter une QOS avec directement des paramètres : # sacctmgr -i add qos high set priority=1000# sacctmgr -i add qos medium set priority=500# sacctmgr -i add qos low set priority=100 AffichageAfficher la QOS ParticuleCalc : # sacctmgr show ParticuleCalc Afficher
Il est possible de spécifier une QOS (Quality Of Service) pour chaque job soumis dans Slurm, la QOS affectera le job de 3 façons : Priorité Préemption Limites C’est la commande sacctmgr permet de gérer la QOS. Quality Of ServicePour changer et activer la QOS, il faut activer le plug-in Multifactor Job Priority en changeant l’option PriorityType à priority/multifactor dans slurm.conf Fichier slurm.conf : # Activate the Multifactor Job Priority Plugin with decay# PriorityType=priority/basicPrio
SGE est l’ordonnanceur de taches qui permet aux utilisateurs de soumettre leurs jobs. Chaque noeud de calcul execute un daemon sgeexecd pour dialoguer avec le daemon qmaster. Ce dernier permet de tout orchestrer. Listes des commandesSeul le role des commandes est decrit, les options de celles-ci etant consultables avec man. Commandes d’administration Commande Explication # qconf Commande de configuration en mode texte # qmon Gestion complete du cluster en mode graphique # qmod Gestion d