SLURM - Stats & Diagnostic
Pour effectuer des diagnostics et sortir des statistiques sous SLURM, on peut utiliser 3 commandes : # sdiag# sacctmgr show stats# sacctmgr show problem Commande sdiagUtilitéLa commande sdiag permet
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Il est possible de paramétrer des queues sous SGE avec la commande qconf. Lister les propriétés des queuesLister toutes les queues : # qconf -sql Détails d’une queue en particulier : # qconf -sq <
Parfois il arrive que des utilisateurs aient lancé des jobs sur une queue avec une QOS (de temps) trop courte et que leurs calculs ne puissent pas se finir dans le temps imparti. Pour leur accorder du
Dans notre cas nous devons basculer 3 noeuds actuellement sous gestion SGE vers SLURM, les noeuds à basculer sont mynode05, mynode06, mynode07 et mynode08. Administration sous SGEAffichageOn affiche l
Pour observer de plus près le comportement d’un job, on peut utiliser la commandes qstat. Extrait du manL’aide de la commande précise : # qstat --helpusage: qstat [options] [-ext]
Les commandes qstat et qmod affichent les informations des jobs dans la file d’attente. Les jobs passent généralement par plusieurs statuts au cours de leur exécution. Les statuts typiques sont pendin
La commande squeue affiche les informations des jobs dans la file d’attente sous forme de plusieurs colonnes dont ST et NODELIST (REASON). La colonne ST indique le statut du job et NODELIST (REASON) d
Pour observer de plus près le comportement d’un job, on peut utiliser les commandes sstat, ssacct, scontrol et même squeue. Extrait du manL’aide des commandes précise : squeue : afficher les info
Parfois les clusters de calcul subissent de fortes charges, dûes à des résidus de calculs terminés qui peuvent toujours apparaître dans la liste des processus, SGE est censépourvoir gérer ce type de p
Pour limiter le nombre de calcul lancé par un utilisateur, il est possible de paramétrer un script dans le fichier prolog de SGE en appelant un autre fichier, ici nomé MaxJobs contenant les restrictio
Le dossier <$SGE_ROOT>/site/ comporte un certain nombre de fichiers définissant le comportement de SGE, ce dossier contient également les fichiers prolog et epilog. Fichiers de configurationSi c
Parfois un script ne peut pas se lancer car la queue a été paramétrée avec une classe Les classesLes classes sous SGE ? A Job Class is :A set of jobs that are equivalent in some sense and treated sim
Vous trouverez ci-dessous un certain nombre d’exemples de scripts pouvant être utilisés comme modèle pour créer vos propres scripts de soumission SLURM. Simple scripts de soumissionLes jobs nécessiten
Equivalences des commandes SLURM/SGE Commandes utilisateur Explications Commande Slurm Commande SGE Interactive login # srun --pty bash # qlogin # srun -p "part_name" --pty bash
Il existe quatre composants principaux dans Slurm : le compte Unix, les groupes Unix, les comptes Slurm et les associations Slurm. Sous UnixCompte/utilisateur UnixTout utilisateur doit avoir un compte
Il est possible de spécifier une QOS (Quality Of Service) pour chaque jobs soumis dans Slurm, la commande sacctmgr permet de les gérer. Gérer les QOSManipulation des QOSAjoutAjouter une nouvelle QOS :
Il est possible de spécifier une QOS (Quality Of Service) pour chaque job soumis dans Slurm, la QOS affectera le job de 3 façons : Priorité Préemption Limites C’est la commande sacctmgr permet de g
SGE est l’ordonnanceur de taches qui permet aux utilisateurs de soumettre leurs jobs. Chaque noeud de calcul execute un daemon sgeexecd pour dialoguer avec le daemon qmaster. Ce dernier permet de tout
Un script en bash pour surveiller vos noeuds sous SLURM, le script vérifie si les noeuds tombent en drain ou drng et les relance automatiquement, il récupère ensuite les logs d’erreurs de SLURM sur le
SGE est capable de gérer les ACl en interne. Les ACL sont utilisées pour définir des projets auxquels des utilisateurs peuvent avoir accès (ou pas) pour exécuter des tâches. Il est possible de défini
La commande clubak permet de rassembler et d’afficher les résultats de clush et pdsh Documentationhttps://linux.die.net/man/1/clubak
La commande clush permet d’exécuter des commandes sur un cluster. Cette commande est interactive ou peut être utilisé dans un scripts shell. Les fonctionnalités diponibles de clush sont : Modes d’exé
Créé à l’origine par l’équipe de développement système HPC Linux du CEA en France, ClusterShell est une bibliothèque de commandes qui permet d’administrer les principaux composants d’un centre de calc
La commande sinfo permets d’afficher des informations comme le statut des noeuds ou des partitions sous SLURM.Cette commande affiche à la fois l’état des noeuds et peut renseigner un complément d’info
Fichiers principaux de SGE Fichiers de logsLes fichiers de logs sous SGE se trouvent : $SGE_ROOT/default/spool/qmaster/messages$SGE_ROOT/default/spool/qmaster/schedd/messages$SGE_ROOT/default/spool/&l