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SGE est l’ordonnanceur de taches qui permet aux utilisateurs de soumettre leurs jobs. Chaque noeud de calcul execute un daemon sgeexecd pour dialoguer avec le daemon qmaster. Ce dernier permet de tout orchestrer. Listes des commandesSeul le role des commandes est decrit, les options de celles-ci etant consultables avec man. Commandes d’administration Commande Explication # qconf Commande de configuration en mode texte # qmon Gestion complete du cluster en mode graphique # qmod Gestion d

[ TITLE    ] : SLURM - Statut des noeuds

La commande sinfo permets d’afficher des informations comme le statut des noeuds ou des partitions sous SLURM.Cette commande affiche à la fois l’état des noeuds et peut renseigner un complément d’information, le code d’état (*, +, %, etc.) Pour des informations plus détaillées (non troquées), il faut utiliser les options N (--Node), e (--exact) et l (--long), la commande est : # sinfo -Nel Flag d’états possibles des noeuds Flag Description * Le noeud ne répond pas actuellement et ne se ver

[ TITLE    ] : SGE - Daemons

SGE est l’ordonnanceur de taches qui permet aux utilisateurs de soumettre leurs jobs. Chaque noeud de calcul execute un daemon sgeexecd pour dialoguer avec le daemon qmaster. Ce dernier permet de tout orchestrer. Daemons SGE Daemons and Other Définition sgeexecd Sur les noeuds qmaster Sur le master Documentationhttps://pmcs2i.ec-lyon.fr/documentation/run/commands.htmlhttps://hpc.llnl.gov/banks-jobs/running-jobs/slurm-commandshttps://slurm.schedmd.com/man_index.html

[ TITLE    ] : SLURM - Daemons

SLURM (Simple Linux Utility for Resource Management) est un planificateur de tâches gratuit et open source pour les noyaux de type Linux et Unix, utilisé par de nombreux superordinateurs et grappes d’ordinateurs dans le monde. Daemons SLURM Daemons and Other Définition slurmctld Contrôleur central (généralement un par cluster) - Sauvegarde facultative avec failover automatique - Surveille l’état et les ressources - Gère les queues et les jobs - Contrôleur central (génér

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SLURM semble down ? Voici un récapitulatif des vérifications préliminaires. VérificationsSlurm répondExécutez scontrol ping pour vérifier que le serveur maître est joignable : # scontrol pingSlurmctld(primary) at <ServerName> is UP Si la commande indique qu’il répond, il peut s’agir d’un problème de mise en réseau ou de configuration spécifique à un utilisateur ou à un nœud du cluster. Slurm ne répond pasExécutez scontrol ping pour vérifier que le serveur maître est joignable : # scontrol

[ TITLE    ] : SGE - Commandes de base

L’interface utilisateur de ligne de commande de Sun Grid Engine consiste en un jeu de programmes (commandes) auxiliaires qui vous permet de gérer des files d’attente, de soumettre et de supprimer des travaux, de vérifier l’état d’un travail et d’interrompre ou d’activer des files d’attente et des travaux. Le système Sun Grid Engine se sert du jeu de programmes auxilliaires suivant : Commandes Commande Définition qacct extrait des informations de comptabilité arbitraire du fichier journ

[ TITLE    ] : SLURM - Commandes de base

SLURM (Simple Linux Utility for Resource Management) est un planificateur de tâches gratuit et open source pour les noyaux de type Linux et Unix, utilisé par de nombreux superordinateurs et grappes d’ordinateurs dans le monde. Commandes de baseFile d’attente = queue = partition dans SLURM Commande Définition sinfo interrogation des files d’attente sbatch soumission d’un job dans une file d’attente (appelées partitions dans SLURM) salloc réservation de ressources en intera

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Problème rencontrés avec des noeuds sous gestions SLURM. Etats possibles des noeuds2022/10/01/SLURM-Status-des-noeuds/ Commandes de baseVérifier l’état des noeudsAffiche uniquement la raison des noeuds en down, drained and draining : # sinfo -R Pour des informations plus détaillées (non troquées) : # sinfo -Nel Affiche le détail d’un noeud en particulier : # scontrol show nodes=<mynode> Equivalent à (sans le “s” à node) : # scontrol show node <mynode> Affiche tous les noeuds en

[ TITLE    ] : SGE - Statut des queues

Dans un premier temps : s’assurer que les noeuds en questions sont bien gérés par SGE Etats des queuesStatuts d’erreur possibleSous SGE, les statuts possibles pour une queue sont : a : alarm c : configuration ambiguous d : disable o : ? (operator) s : Suspending u : unreachable A : Alarm - Quand le noeud est full ou a utilisé toutes ses ressources AU : Alarm - Unreachable AS : Alarm - Suspended - Si le noeud a atteint ses limites, SGE lui interdit de prendre un autre job et attent